眾所周知，主角所處的世界是學園都市並存的綜漫世界。所以。在男主這邊，平靜的東京日常之外。
另一個科技更加發達且充滿超能力者扎堆的城市之中。咱們最可愛的嗶哩嗶哩放電妹，超電磁炮的能力擁有者御坂美琴這一邊。
此時正在進行著自己的日常的御本美琴聽聞了一些奇怪的傳聞。那就是有人能夠在城市的各個地方都看到自己的身影。
但御坂美琴自己卻想到了克隆人，畢竟自己在很早之前因為某項計劃給研究員了自己的一點血液，說是用於治療肌肉萎縮症。
在學園都市的下午，御坂美琴因為聽說最近的奇怪都市傳聞。然後展開了自己的調查，隨後終於見到了關於自己的克隆人。
在一個拐角處的樹邊，御坂第一次邂逅了屬於自己的複製人妹妹大為震驚且極度戒備和提防。
御坂美琴看到了一個長相和自己一模一樣。且表情冷淡，看起來沒什麼情感的複製體，隨後就有些不安的看著這個和自己不管是相貌聲音都一模一樣的存在。
震驚之餘，御坂美琴提出了自己的疑問，那就是對方到底是誰？是想要做些什麼？還是說想要替換掉自己？
“喵～”
對方突然間喵了一聲，給極度戒備的御坂美琴整懵了，然後就立刻卸下了防備。
“哈？！”
隨後，御坂美琴就開始詢問這位。御坂妹妹得知她的編號是御坂9982號。
隨後這位呆呆的妹妹便尋求御坂美琴的幫助，想要救助在樹上的一隻黑色的小貓。
但御坂美琴則認為，這隻貓就算掉下來，也不會受傷，便有些想要拒絕。
最後御坂美琴又因為一些接觸和搭訕，逐漸的對這個和自己一模一樣的複製人產生了些許的情緒感。
甚至還請這位御坂妹妹吃了自己很喜歡吃的雪糕，不過御坂妹妹好像並不是很在意一樣。
只是呆呆的吃掉了。甚至還毫不防備的露出了胖次，彷彿對這些常理的事情並不是過多瞭解一樣。
弄得御坂美琴非常羞澀，畢竟對方和自己長得一模一樣，這種有些羞恥的事情，她是實在無法接受的。
然後又拿出自己不敢佩戴的呱太胸針給對方別上。隨後便被對方認為是姐姐大人送給自己的禮物，而表示非常喜歡隨後就收下了。。
儘管御坂妹妹並不理解或者對這些東西有什麼其他想法，但御坂妹妹只是覺得這個東西很重要，自己要好好保護，畢竟是來自姐姐的禮物。
而實在好奇這位御坂妹妹，帶著軍用夜視儀揹著一個包的古怪模樣，並說的要去參加實驗之後。
御坂美琴還是利用自己的能力黑入到了學園都市的網路查詢關於御坂妹妹們的資料 ，最重要的是知道御坂妹妹要去進行什麼實驗。
最終御坂美琴找到了一個所謂的超能力者進階計劃，那就是由一方通行殺掉2萬個御坂妹妹就能進化成絕對能力者。
同時計劃的最初設定是，超能力者一方通行他必須必須在各種型別的實戰中要殺掉128名超電磁炮擁有者，才能夠得到進化變成LV 6變為絕對能力者。
但學院都市裡的七位超能力者，超電磁炮的御坂美琴只有一名，所以量產妹妹計劃開始實施部署。
這種極其恐怖且讓御坂美琴無法接受的事情還是引起了少女的重視，同時御坂美琴也看到了各種資料，然後就注意到最近的實驗節點以及實驗地點，立刻焦急的開始往目標地點趕去。
因為這個目標的姓名就是自己第一次見到的御坂妹妹，所以她很焦急。
因為這個是以命相搏的實驗。那就是不管是雙方誰對誰錯，都只有一個目標，那就是殺死對方。
。妹妹的亡死定註將即個這找尋要想的急焦，尋搜的急焦，跑奔的急焦始開琴坂是於
