葛城美里的臉色瞬間沉了下去，渾身的血液彷彿都凝固了。
而就在指揮室陷入死寂之時，碇源堂，那不帶絲毫感情的聲音響了起來，
「零號機，出動。」
……
與此同時，避難警報響徹了整個學園都市。
碇真嗣正隨著擁擠的人潮，被動地朝著地下避難所移動。
初號機依然被封存凍結，他現在只是一個手無寸鐵的普通中學生，什麼也做不了。
他茫然地抬起頭，透過人群的縫隙，看到了遠方天際線下，一臺藍白相間的零號機，正被髮射系統彈射升空。
而在它的目標方向，另一臺漆黑的EVA，正以一種極其詭異的姿態，緩緩地站立著。
為什麼……為什麼零號機的對手是EVA?
一個又一個疑問在他腦中炸開。
然後，像是被一道閃電劈中，所有的線索在瞬間串聯了起來。
今天一早請了假的明日香……
劍介無意中提起，說今天NERV在松代有三號機的秘密啟動實驗……
遲遲沒有出動的二號機……那臺漆黑的EVA……這一切，都指向了一個他不敢。也不願去相信的恐怖事實。
那臺被判定為使徒的三號機裡的駕駛員……是明日香！
「明日香……」
碇真嗣的嘴唇無聲地顫抖著，如遭雷擊般愣在原地。
下一秒，他猛地轉身，用盡全身的力氣，逆著奔逃的人流，向外衝去。
他撞開了一個又一個驚慌失措的路人，在一片咒罵和驚呼聲中，跌跌撞撞地找到了一個公共電話亭，然後撥通了NERV的內部通訊。
「美里小姐！」
電話接通的瞬間，他幾乎是吼了出來，
「三號機裡的駕駛員，是明日香嗎？！」
電話那頭沉默了片刻，那短暫的寂靜彷彿有一個世紀那麼漫長。
「……沒錯……」
然後，葛城美里疲憊而沉痛的聲音傳來。
「讓我駕駛初號機出擊！」
碇真嗣深吸了一口氣，做出了決定。
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