二十多年前，沙漠地帶掉落了一個神秘的發光體，人們從中捕捉到了數具不定形的生命體，也就是我們所熟知的水母星人來訪者。
透過來訪者，TLT得到了龐大的知識和情報，造就了這種種超越時代的先進武器，比如記憶消除器、夜襲隊戰機等等。
為了避免地球和自己星球一樣滅亡，來訪者將這些武器和知識交給了TLT，並與之簽訂了條約。
隨後，5年前，新宿大戰中巨人和異生獸第一次出現，來訪者們為了避免因為群眾的恐慌而造就更多更強的異生獸，將全世界的記憶封印，抹去了關於5年前新宿慘案的真相。
而那些封存的記憶，就是被TLT設為機密的遺忘之海 Lethe。
會議中，和倉同水原沙羅的對話中得知了這一切。
同時，夜襲隊的休息室內，石堀也入侵了北美總部，獲取到了關於新宿事件的影片資料。
看著螢幕上那恐怖的異生獸和酷似奈克瑟斯的巨人，夜襲隊眾人瞪大了雙眼，盡皆是一副驚訝的表情。
而另一邊，正在和松永管理官女兒漫步公園的千樹憐在對方的引導下終於向瑞生表了白，可不等二人繼續說些什麼，天空中突然出現了一個黑洞。
隨著一道光芒閃過，一隻異生獸從黑洞中飛出，降臨在了市中心的上空。
“異生獸震動波，竟然是在市中心嗎？”
吉良澤優從儀器上監測到了異生獸的出現，馬上按下了警報。
“第12區，地點428的地方，確認有異生獸震動波，請夜襲隊緊急出動。”
休息室內，剛剛看完新宿事件影片的眾人一陣沉默，沒有人回應吉良澤優的指示。
“怎麼了？因為被上層抹去了記憶，就不願意去保護人們了嗎？”
在沉默中，林楓率先開口，聲音迴盪在休息室內，敲進了夜襲隊眾人的心中。
“我只是，不明白為什麼自己也接受了記憶清除。”
詩織搖了搖頭，臉上寫滿了失落，難道，就連身為夜襲隊的自己，上層也需要隱瞞嗎？
“我知道你們在想什麼，但是在這一刻，異生獸出現的那邊，會有很多人倒下！”
和倉隊長打開了門，他已經聽到了休息室內的聲音，看著螢幕上的耐克斯特，他繼續道。
“現在，你們應該知道自己要做什麼吧？”
“隊長，等回來的時候，再請你做出說明。”
西條風第一個站了出來，隨後，眾人一同點了點頭，夜襲隊再次出動。
另一邊，市中心，人們哭喊著逃命。
空中，異生獸發動了彩色光束，將一個又一個人類包裹起來，送入了體內。
“千樹，不要啊！”
將救下的一個小孩丟給瑞生之後，千樹憐再次逆流而上，衝向了異生獸，只留下原地的瑞生焦急的呼喊。
“啊！”
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