兩百多逸見軍在野地對陣擁有精銳騎兵的一千餘武田軍，結果是可想而知的，在巨大的人數和兵源素質的差距面前，約莫兩刻鐘，逸見軍的槍衾方陣便被擊潰，逸見廣忠被山縣盛信一槍討取。
戰敗的逸見軍四下逃竄，松宮清長則率領馬廻眾奪取了河東的渡口，並對擠在渡口爭相上船的潰兵大開殺戮。
凌晨五時，河東的逸見軍基本清理完畢，松宮清長按照義重的命令，開始徵調船隻渡河。
與此同時，熊谷元直和本鄉光泰率領七百餘軍勢抵達河西渡口外圍，與最後一批逃回河西的逸見軍發生遭遇戰。由於心魂未定、士氣不振，加之主要是內藤勝高招攬的散兵遊勇，因此很快便被熊谷元直率領的若狹眾擊潰，河西的渡口順勢被武田軍佔領。
至此，佐分利川渡口之戰，武田軍先後擊殺、擊潰逸見軍三百七十人，逸見昌經父子及內藤勝高則率領殘餘的一千餘人向福谷坂方向撤退。
二十六日清晨，約莫七時，義重率領剩餘的武田軍渡過佐分利川，在河西集結完畢。稍事休息後，立即北上直衝福谷坂，準備趁逸見軍立足未穩，一舉將其殲滅。
此時，另外兩路武田軍的形勢並沒有太大變化。
首先，進攻吉坂峠的熊谷隆直和白井清胤，經過二十五日一整天的車輪戰攻擊，基本掃清了吉坂砦的外圍工事，雖說損失了接近一百人，但本丸內的逸見軍也傷亡不輕，加之前無糧草、後無援軍，一股失敗、壓抑的氣氛在城中漸漸瀰漫開來，逸見昌虎面臨的譁變風險逐漸增大。
其次，死守加悅城的鬼庭雅昭和白井光胤，則已經第三次擊退了但馬山名軍的進攻，兩軍圍繞加悅城外圍陣地保持著激烈的交鋒，縱使田結莊是義和垣屋光成再怎麼強攻，也無法突破武田軍在南曲輪的防線。
不過上述戰場上的僵持，在二十六日，發生了巨大轉折。
上午十時，義重率領三千六百名武田軍抵達福谷坂南端。而逸見軍剛剛經歷了渡口的潰敗，軍心渙散，沿途潰逃者甚眾，逸見昌經父子真正能聚攏佈陣的軍勢不超過九百人，這其中還有三成是內藤勝高招攬的烏合之眾。
由於時間緊迫，內藤勝高縱使提前抵達福谷坂，也沒有完成防禦工事的修建，逸見昌經因此一度想要退守碎導山城進行籠城。
但義重並沒有給他這個機會，逸見軍殘部前腳抵達福谷坂，義重率領武田軍後腳趕到。無奈之下，逸見昌經只好在坂口進行佈陣，與武田軍進行決戰。
隨著法螺號的吹響，三波箭雨輪番傾瀉在了逸見軍的陣中，隨即武田軍以熊谷元直為前鋒，率先向逸見軍發起進攻。內藤勝高則作為逸見軍的前鋒，率領自己招募的兩百多散兵遊勇向武田軍殺去。
沒過多久，內藤勝高開始不支，逸見昌清奉命率軍前去支援，但在兵力、士氣懸殊之下，逸見軍始終無法挽回頹勢。戰至中午時分，逸見軍防線多處出現紕漏，陣型開始出現動搖。
義重見狀，立即命令山縣盛信出兵。在赤色騎馬隊的衝擊下，逸見軍的防線開始出現崩潰，內藤勝高在撤退途中，被久村光泰麾下武士坂本權五郎討取，逸見昌清也身受多處刀傷，在側近掩護下退回本陣。
由於逸見軍在坂口布有防馬柵，義重命令山縣盛信暫停進攻，轉而由武藤光佑率領弓足輕前移，配合松宮清長清除防馬柵。期間，內藤勝高之子內藤勝光被射殺。
下午二時，在松宮清長的奮戰下，坂口東部的防馬柵被清除，武田軍魚貫而入，攻入逸見軍本陣。隨後，山縣盛信再度率領騎馬隊衝鋒，連續討取多名逸見軍武將，迫使逸見昌經動用最後的馬廻眾前去阻擋。
此時，武藤光憲、武藤光佑兄弟率一部武田軍繞襲逸見軍側後方，與逸見昌清展開激戰。約莫半個時辰後，逸見昌清率先不支，在撤退途中被武藤光佑所攔，雙方爆發了一騎討，三十餘回合後，逸見昌清被討取，所部盡數潰散。
得此噩耗，逸見軍軍心大亂，開始出現大量逃兵。逸見昌經自覺無法逃出生天，便手持長槍，率領一眾側近衝入陣中，與武田軍展開最終的決戰。
戰至下午三時，逸見昌經與十餘名馬廻眾被松宮清長率部包圍。多次勸降無果後，松宮清長下令發起總攻。面對數十倍於己的武田軍，逸見昌經毫無招架之力，很快便死在亂軍之中，其首級竟被一名足輕討取，著實令人唏噓。
隨著逸見父子的先後敗亡，剩餘的逸見軍見狀紛紛繳械投降。
截至下午三時，福谷坂合戰，這場若狹歷史上規模最大的合戰，以義重率領的武田平叛軍大獲全勝而宣告結束。隨後，義重在眾將簇擁下兵不血刃地佔領了碎導山城。
逸見氏戰敗的訊息，很快便在若狹、丹後傳開，逸見氏領內的城池多是“不攻自拔，傳檄而定”，而那些或明或暗支援逸見昌經的地方勢力，也紛紛派人前往碎導山城向義重宣誓效忠。一時間，若狹及丹後東部幾近平定。
傍晚時分，逸見昌經戰死的訊息傳到了吉坂峠，熊谷隆直和白井清胤大喜過望，立即派遣使者前往吉坂砦勸降逸見昌虎。
父兄皆戰死，成為壓垮逸見昌虎的最後一根稻草。眼瞅著城中人心不穩，抵抗已無意義，他最終答應了武田軍的要求開城投降，至此，逸見氏之亂徹底平息。
當天深夜，兩封戰報同時傳到了加悅谷外的山名佑豐本陣。
一封來自但馬國內，是說因幡山名軍突然入侵，奪取了包括溫泉城、鶴峰城在內的多座重鎮，現正由武田國信率領圍攻八木城。
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