艦隊在琉球停靠了十日。
這十日里，鄭經派遣了部分將士和琉球當地民夫一起拓寬那霸港的泊位和棧橋，確保今後鄭氏的大型戰船和商船都能順暢停靠。
同時在港口旁的海岸高地上修築了一座小型城堡，城堡雖小，卻是大明在海外築起的第一座永久性駐軍要塞。
城堡落成之日，鄭經將一面“明”字旗親手插上城頭，又留下一百名將士留守。
一切安排妥當，艦隊方才揚帆起錨，繼續北上，朝日本長崎方向破浪而去。
一路上風平浪靜，東海在正月裡溫順得很，連稍大些的浪頭都沒碰上幾個。
東海的風浪一般集中在7-9月。
航行十日之後，前方海平線上終於浮現出日本九州的海岸線，長崎港外那些熟悉的島嶼輪廓在晨霧中漸漸清晰。
百艘戰船排成整齊的縱隊，桅杆上“明”字旗迎風獵獵，朝長崎港緩緩逼近。
長崎港內的日本巡邏船遠遠望見這片遮天蔽日的帆影，頓時慌了手腳，銅鑼聲響成一片，整個港口亂成了一鍋粥。
長崎是日本德川幕府直轄的領地，也是整個日本唯一對外開放的港口。
幕府在此設立長崎奉行所，由長崎奉行統轄港口貿易。外交和治安大權。
現任長崎奉行名叫島田守政，是幕府將軍是德川家綱的心腹大臣。
1612年，日本幕府將軍德川家康頒佈禁教令，在幕府直轄地禁止基督教，這是鎖國禁海政策的開端。
到了1641年，日本幕府驅逐了西班牙。葡萄牙。英國，將荷蘭東印度公司的商館從平戶遷至長崎，且只開放長崎一個口岸，禁海鎖國體制最終完成。
幕府之所以鐵了心推行鎖國，歸根結底是為了鞏固德川家的絕對統治。
此前基督教在日本迅速傳播，被幕府視為西方勢力滲透的先頭部隊，若不斬草除根，遲早會動搖德川幕府統治的根基。
於是幕府開始全面禁教，取締所有教堂，強迫教徒改宗，並對試圖潛入的傳教士處以極刑，徹底斬斷西方思想在日本的傳播渠道。
此外，對外貿易十分暴利。
幕府認為若被各地大名把持，坐擁商港的大名勢必坐大，進而威脅幕府的權威。
唯有將貿易暴利全部收歸幕府直轄，把利潤牢牢攥在自己手裡，才能一勞永逸地扼殺大名坐大的隱患。
於是長崎奉行應運而生。
禁海鎖國並非完全斷絕貿易，而是把利潤豐厚的外貿統統收歸幕府壟斷。
荷蘭人之所以能留下來，全靠他們向幕府反覆保證絕不在日本傳教，只做生意，不問政治。
加上長崎奉行所每年從荷蘭商館收受大筆賄賂和貢禮，實打實的利益讓幕府對他們網開一面。
至於大明商船，待遇則更為寬鬆。
日本對中國商品的需求量極大，生絲。瓷器。藥材。書籍都是日本無法自產的必需品，幕府不願也不能切斷這條貿易線。
加之大明與日本並無宗教衝突，因此大明商船得以自由進出長崎港，享受比荷蘭人更優厚的通商條件。
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