舊型方舟反應爐的改造升級，其實一開始只朝著兩方面下手，一是建造反應爐的材料與設計，一是控制系統。並沒有直奔理論，動反應爐的核心部分。
相較於完成在上個世紀67年的方舟反應爐，當時最先進的配套科技，如今已經是落後三十六年的老東西。說淘汰倒不至於，但有不少東西都已經有更好的選擇了。
譬如控制系統的升級。經歷先期規劃，然後新舊雙系統並行，離峰時段移轉控制權，並進行壓力測試。
等到完全沒問題之後，才將控制權限完全轉移到更便捷，以及安全性更高的新系統上。
建造材料的汰換升級，也是視不同部位、不同重要性來進行的。譬如有複數管道的，就利用離峰時段，壓力較小的時間，逐一更換升級。
無法在熱運轉狀態下做更換的，則制定計劃。預備放在聖誕節─新年假期，停機歲修的時候一併完成。
這也是為什麼從一開始的時候，參與方舟反應爐升級計劃的一般研究人員有辦法協助的理由。因為託尼·史塔克等人做好規劃，就由底下的人執行。
託尼·史塔克、奧托·奧克塔維斯和亨利等三人，也不全在做這些無關緊要的小事。他們將跟方舟反應爐有關的所有學術論文從頭開始梳理，完善缺失的理論。
希望在沒有關鍵參照物——即宇宙魔方。不過此時除亨利外，沒有人知道這點，——可以參考的情況下，讓方舟反應爐的冷核聚變理論可以邏輯自洽。
一般來說，一套理論要是缺了核心的部分，只有開頭跟結尾，這套理論直接扔進廢紙簍也不為過。
偏偏方舟反應爐有一個已經在實際運轉的實體存在，證明這套理論的開頭與結尾是正確的。那麼如何補全這個缺失的核心，就成為一道難題。
沒有可參照物，就算亨利有超級大腦，他也無法憑空想象出答案來。所以他就陪著另外兩人慢慢推導，一齊將方舟反應爐的所有方程式一一補全。
作為冷核聚變的標誌性反應爐，是利用‘鈀’元素為電極，在常溫、常壓的重水中進行電解。除了產生氫，還可以釋出渺(μ)子。
渺子是一種不穩定的亞原子粒子，類似電子，但質量是電子的207倍以上。
只要讓渺子在氫分子中取代一個電子，就會因為質量變大，讓氫分子中的氫原子核互相吸引，比一般狀態下更為靠近，從而誘發核聚變反應。
這套方法，在亨利穿越前的世界同樣存在。然而渺子催化融合早在1950年代，就已經被證實不具有實用價值。
因為渺子壽命太短暫，可用於觸發核聚變的時間視窗極短。又很難控制，難以使其進入原子核周圍軌道，取代電子。無法取代質量小的電子，就不會有後續的反應。
但是在漫威宇宙，這個方法被實現了！
要點就在於讓整套流程跑起來，並利用磁約束技術，將其限制在極小範圍內，增加渺子進入原子核周圍的機率。而不是在靜態狀況下，被動等待渺子偶然間取代電子。
而被取代的電子則會被釋放出來，成為自由電子。當多個自由電子共同移動，所產生的淨流動現象就稱為電流，這便是可輸出的能量了。
整個過程，雖然也會有放熱現象，但基本上都還是維持在常溫、常壓狀態。沒有出現離子流等級的超高溫，也不需要利用這些的熱量去轉換成電力。
但是這套以冷核聚變為基礎的方舟反應爐，也不是毫無缺點。縱使在亨利等人的計算中，有辦法提高效費比，使其具備商轉價值，但是核廢料的汙染，又成為另一道難題。
核聚變發電的一大賣點，就是乾淨無汙染。聚變反應後的物質，是不具有輻射線，更不是半衰期長達幾萬年的核廢料。
然而以鈀元素為電極的方舟反應爐，雖說同樣不會產生出帶有輻射的廢料，但是鈀元素會被分解滲入重水中，造成重金屬汙染。
這和標榜乾淨無汙染的核聚變發電技術明顯還有段距離。偏偏史塔克家父子都是光明磊落的性格，有啥說啥，不懂得，也不屑於粉飾太平。
這也是從以前至今，方舟反應爐受環保群體阻撓，無法推廣的一大理由。
但其實重金屬汙染的問題，可以放在事後解決。三十六年前建成的方舟反應爐，就是將汙染水另行淨化，一樣可以做到無汙染排放。
不過對於那群環保魔怔的人，再怎麼解釋也是枉然。更不用說裡頭有不少是別有用心的群體，只是藉著環保說話而已。
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