隨著總督府的發展，在其體制日益完善的同時，其結構框架的組成也變得越來越複雜。
除總督府既有的本部系、五虎將等直屬於總部的提督建立起來的特本部系，以及武藏和法迪默等艦娘建立起來的直本部系以外，還有特殊系、外聯絡與獨立系等分支存在。
特殊系，指的是由多名提督聯合組建起來的特殊分部、特殊支部，以及校級以上提督建立起來的公會等團體勢力。
這些團體勢力雖自成一體，並擁有一定的主權，卻沒有超脫總督府的體制範疇，儘管與本部系的提督有了明顯的區別，可實際上仍屬本部系的一部分。
外聯絡，指的則是沃徳星九大聯邦與瓦爾星三大聯邦一系，透過委培的方式形成的提督群體。
他們雖掛名在本部系底下，可實際上卻是以其所屬的本土勢力為核心的友軍單位，不在總督府的直接統屬範圍。
至於獨立系的部分，指的則是沃徳星的野生提督，以及白砂星西擎洋的斯塔克這種不在總督府的體制當中，卻又維持一定合作關係之提督群體。
他們雖有獨立的主權，可以主掌其統治範圍內之一切事務，卻也失去了總督府提供的所有權益和保障，需獨自面對深海所帶來的威脅。
當他們在遇到無法應對的威脅，要想借助總督府的力量來處理，就必須付出相應的代價。
把所有好處都拿走，然後把所有的風險丟給總督府來承擔？這是不可能的事情！
正所謂，有人的地方就有江湖，人與人之間的關係，往往不止一面，在六系提督因各自的利益訴求，相互結盟與對立的情況下，總督府現在的內部格局有多麼地複雜，也就可想而知。
沃徳星這邊的烏爾聯邦、雅託聯邦和藍多聯邦，在結合賽特姆文明的科技，整出碧藍機娘以後，便將重心朝碧藍機孃的部分傾斜。
其所屬的提督和艦娘，本就不怎麼受待見，在這樣的情況下，日子就變得更加煎熬了。
要不是這三個聯邦還想從總督府這邊撈好處，只怕早已不再派遣適格者前往沃徳星學員就職提督和艦娘。
這也導致其所屬的提督和艦娘，在沃徳星這邊不僅是數量最少的，整體實力也是最差的。
隨著碧海機孃的數量越來越多，終是引來了海妖塞壬的注意，從而跨越位面進入沃徳星之中，與深海爭奪起了海域的控制權。
深海在沃徳星這邊的實力雖然強大，可終究還是太過分散了一些，在海妖塞壬不斷地湧入的情況下，漸漸地還是有部分海域落入其掌控。
當海妖塞壬在沃徳星站穩腳跟以後，便在第一時間找上了烏爾聯邦、雅託聯邦和藍多聯邦。
三大聯邦要是對其所屬的提督和艦娘好一點，派遣至沃徳星學院就職提督和艦孃的人數再多一點，這些提督和艦娘或許攔不住海妖塞壬的入侵，倒也不至於連探查都探查不到它們的存在，然後讓它們長驅直入地進入其領地範圍，從而造成巨大的損傷。
只是，三大聯邦不僅沒有檢討自己的問題，還將責任怪到這些提督和艦孃的頭上，將其原本就不算多的資源供給削去大半，然後投注在碧藍機娘上面。
在這樣的情況下，面對深海與海妖塞壬雙重威脅，這些提督和艦娘為了自保，只能向總督府這邊進行求援。
乍看之下，這些提督和艦孃的求援，似乎沒有太大的問題，可實際上剛好相反。
要知道，距離海妖塞壬入侵事件，可是已經過去了大半個月的時間，沃徳星這三大聯邦要想這麼做，當時早就已經做出決定了，根本不會拖到現在。
在其做出決定的第一時間，這些提督和艦娘不尋求其它解套的方法，就對總督府發出求援的請求，而且還專挑總督沐雲剛把安薩露美恩和珍娜派去雲頓星和瓦爾星支援的時候。
要說這裡面沒有沃徳星這三大聯邦的算計，純粹只是巧合，總督沐雲打死都不相信。
很顯然，沃徳星這三大聯邦既不想繼續在那些提督和艦孃的身上砸資源，又不想讓他們才剛形成規模的碧藍機娘出現太大的損傷，想要玩一把空手套白狼的把戲，先讓總督府幫他們擺平深海與海妖塞壬的威脅，再將責任盡數推到那些提督和艦孃的身上，從而省去他們本應付出的代價。
沃徳星這邊如此，白砂星那邊的情況也沒有好到哪裡去，雖然斯塔克此前已經對白砂星的本土勢力敲打過一番，卻沒能打消其作死的打算。
在蟄伏一段時間以後，他們便再次蠢蠢欲動了起來，只是這一次，他們並沒有再與斯塔克通氣，準備來一個生米煮成熟飯，將白砂星其它三洋的控制權拿下，再倒逼斯塔克與其共進退。
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