每當一輪迴結束，每次完成補完之後，心有不甘的澱真嗣總會因為種種緣由而變得愈發偏執狂躁，進而選擇重新啟動輪迴程式，
每次輪迴後，碇真嗣都會淪為凡俗之人繼續進行下一次的補完。
如此週而復始，年復一年，日復一日，他的神力也在這般漫長歲月裡一點一滴地匯聚沉澱，
最終又被他全部拋棄，進而演化成了能夠貫通世間萬物，連線無數因果的恐怖存在——根源之渦！
也正因如此，加夫之門才得以誕生，事實上加夫之門這東西在最初之時根本不存在，是後續隨著時間線的輪迴不斷疊加因果才出現的特殊規則之物。
人類補完竟然在逆轉……這怎麼可能！?
NERV島國分部總司令，碇真嗣的父親，碇源堂瞪大雙眼，滿臉驚愕地望著那遮天蔽日、覆蓋全球的巨大光翼，整個人的精神都有些崩潰。
在那片耀眼光芒之中，所有曾經被聚合成為半成品試圖的存在都瞬間化為了普通人類。
這個結果完全超出了碇源堂的預料，他精心策劃長達數萬年之久的計劃就這樣功虧一簣，如此沉重的打擊令他幾乎無法承受。
然而就在下一刻，他卻突然變得平靜下來，彷彿一切都已釋然，甚至連嘴角都忍不住上揚。
原來，隨著人類補完計劃被逆轉，所有的 EVA 和使徒也一同被瓦解消散。
那些先前被 EVA 吞噬的靈魂終於重獲自由，再度降臨世間，並被神給予了全新的身軀，得以復活。
其中最為引人注目的當屬初號機，它在被光翼吸納之後，將碇源堂朝思暮想了數萬載歲月的妻子：碇唯竟抱著碇真嗣從新出現了眾人面前。
不僅如此，曾遭使徒毒手的明日香，還有被二號機吞噬掉的明日香的母親——惣流·恭子·齊柏林，亦相繼隨著使徒和 EVA 的消逝而重現於世。
而她們的復生知識一個開始，在EVA消融之後，一切的起源，使徒的最初兩位始祖：亞當與莉莉絲，也隨之消散。
剎那間，一片翠綠欲滴、洋溢著勃勃生機的光雨，它們如輕紗般輕柔地飄灑而下，滋潤著這顆飽經滄桑的星球。
原本瀰漫於天地之間的猩紅血色迅速褪去，取而代之的是肉眼可見的植物從大地之下生長出來。
如果站在天空之上俯瞰下去，便會驚奇地發現，那顆原本被鮮血染成猩紅一片的地球，此刻正以驚人的速度煥發出勃勃生機。
它就像是一個沉睡許久後剛剛甦醒過來的巨人，慢慢地舒展著身軀，展現出那令人歎為觀止的生命力和活力。
隨著時間的推移，地球表面開始呈現出藍、綠、黃三種色彩交織融合在一起的奇妙景象——這正是人類所熟知的那個美麗星球本該應有的模樣！
我終於親眼目睹到了這一刻……所有人都能夠獲得真正意義上的幸福美滿生活下去!
第十三使徒渚薰激動萬分地張開雙臂，盡情享受著這場如甘霖般灑下的生命之光雨洗禮。
他昂首向天，目光凝視著遙遠天際處宛如神只降臨世間般耀眼奪目的存在，但眼神里流露出的卻是前所未有的希冀與崇拜。
雖然這一切沒有按照真嗣的劇本來進行，但它卻比真嗣的劇本更加完美，所有人都獲得了救贖。
與此同時，律子也置身於這片光雨之中，然而她所體驗到的感受卻截然不同。
當那些溫暖柔和的光芒觸及她身體的時候，她突然感覺到一股無法言喻的力量正在迅速侵蝕著自己的意識。
緊接著，一段段曾經無比清晰深刻的記憶竟如同決堤洪水一般從腦海深處洶湧而出，並在快速變得模糊不清起來!
怎麼回事? 我的記憶……所有關於EVA，關於使徒，關於人類補完計劃的一起，它們正在不斷流失?
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