先是，楊廣選了驍健官奴數百人置玄武門，謂之給使，以備非常，待遇優厚，至以宮人賜之。司宮魏氏為帝所信，宇文化及等結之，使為內應。是日，魏氏矯詔悉令給使出外，倉猝之際，無一人在者。司馬德戡等引兵自玄武門入，楊廣聞亂，易服逃西閣。
裴虔通與元禮進兵排左閣，追之而至，問：“陛下安在？”
有美人出，指之。
校尉令狐行達拔刀直進，楊廣躲在閣內，映窗扉謂令狐行達說：“汝欲殺我邪？”令狐行達答道：“臣不敢，但欲奉陛下西還耳。”因入閣內，扶楊廣下來。裴虔通本楊廣為晉王時的親信左右，楊廣見之，說道：“卿非我故人乎！何恨而反？”裴虔通說道：“臣不敢反，但將士思歸，欲奉陛下還京師耳。”楊廣說道：“朕方欲歸，正為上江米船未至，今與汝歸耳！”
一番對答，不外乎互以假話相欺，彼此心知肚明，裴虔通勒兵，暫將楊廣看守住。
天亮後，孟秉以甲騎迎宇文化及。
宇文化及戰慄不能言，沿途有來謁見他的，他唯俯首據鞍，自稱罪過。
至城門，司馬德戡迎謁，把他引入朝堂，當場號為丞相。
裴虔通聞宇文化及等已到，便對楊廣說：“百官悉在朝堂，陛下須親出慰勞。”
已到這種時候，楊廣居然還嫌馬上的鞍勒粗弊，就給他換了新的，他乃乘之。
裴虔通執轡挾刀，挾持著楊廣出了宮門，謀亂的眾人見狀，喜譟動地。
瞧見楊廣被押出，宇文化及倒是嚇了一跳，趕緊大聲喊道：“何用持此物出，亟還與手。”——“此物”也者，楊廣是也；“還與手”也者，趕緊殺了之意。叛亂，本非宇文化及敢為，故而雖然硬著頭皮，接受了為主之請，他卻心虛不已，擔心楊廣一露面，會導致叛亂失敗。
楊廣問道：“世基何在？”叛黨馬文舉回答說道：“已梟首矣！”
於是引楊廣還至寢殿，裴虔通、司馬德戡等拔白刃侍立。
楊廣嘆道：“我何罪至此？”馬文舉責備他，說道：“陛下違棄宗廟，巡遊不息，外勤征討，內極奢淫，使丁壯盡與矢刃，女弱填於溝壑，四民喪業，盜賊蜂起；專任佞諛，飾非拒諫；何謂無罪！”楊廣被他責以大義，卻也知羞慚，但也有反駁，說道：“我實負百姓。至於爾輩，榮祿兼極，何乃如是！今日之事，孰為首邪？”司馬德戡說道：“溥天同怨，何止一人！”
宇文化及又使封德彝數楊廣之罪。
楊廣說道：“卿乃士人，何為亦爾！”
封德彝名倫，是河北景縣人，出身渤海封氏，此前依附虞世基，是虞世基的心腹謀主，虞世基之寵日隆，而隋政日壞，皆他所為。把隋政搞得不可收拾了，他現又從附叛者，論之節義，端得令人不齒。卻也自知自己的行徑卑劣，被楊廣一責，封德彝赧然而退。
楊廣愛子趙王楊杲，年十二，見楊廣受辱，號慟不已。裴虔通二話不說，上前一刀斬之，血濺到楊廣的衣服上。叛者鼓譟，跟著就欲弒殺楊廣。楊廣畢竟是一朝天子，有其尊嚴，死到臨頭，既不可免，他就說道：“天子死自有法，何得加以鋒刃！取鴆酒來！”
到寢殿後，楊廣一直是站著的，馬文舉等不許，使令狐行達“頓帝令坐”。頓，不是普通的推搡，是暴力的按壓。至此，楊廣皇帝的威嚴可謂蕩然無存。可是身為皇帝，怎能死於刀刃之下？楊廣自解練巾，給了令狐行達。令狐行達從背後勒住他的脖子，將他縊殺。
人被縊殺時，由於缺氧導致的神經失控和肌肉鬆弛，往往會出現大小便失禁的情況。
宇文化及、司馬德戡等人，目睹了楊廣被縊殺的全過程，當楊廣股間汙溼的場景出現在他們的面前，騷臭之味瀰漫殿中，卻這眾人，無人憐惜楊廣的可悲，反而心生厭惡，掩鼻退避。
起初，楊廣自知必及於難，常以罌貯毒藥自隨，謂所幸諸姬：“若賊至，汝曹當先飲之，然後我飲。”及亂，顧索藥，左右皆逃散，竟不能得。蕭後與宮人撤漆床板為小棺，與趙王楊杲同殯於西院流珠堂。
楊廣每次巡幸江都，常以他的弟弟蜀王楊秀自隨。已殺楊廣，宇文化及裝模作樣，與叛黨們說，當奉楊秀立之。這怎麼可能？皇帝都弒殺了，再立其弟為帝？這不是自尋死路？司馬德戡等俱皆反對，乃將楊秀和他的七個兒子也一併殺了；又殺了楊廣的次子齊王楊暕及其二子，並燕王楊倓也殺了，凡在江都的隋氏宗室、外戚，無少長皆死。
唯秦王楊浩素與宇文智及往來，沒有殺掉。
卻這齊王楊暕暱近小人，所行多不法，素失愛於楊廣，恆相猜忌。楊廣起先聞亂的時候，曾與蕭後說：“得非阿孩邪？”阿孩是楊暕的小名。宇文化及使人就第誅楊暕時，楊暕則以為是楊廣要殺他，懇求說道：“詔使且緩兒，兒不負國家！”叛者將他曳至街中，斬之。直到楊暕死，他與楊廣子父之間，都沒搞清楚到底是怎麼回事。天家無恩情，誠哉斯言！
又殺內史侍郎虞世基、御史大夫裴蘊、左翊衛大將軍來護兒、秘書監袁充、右翊衛將軍宇文協、千牛宇文皛、梁公蕭鉅等及其子。
黃門侍郎裴矩頗有遠見之明，知必將有亂，因而平時對待驍果兵士甚厚，又嘗建策為驍果娶婦，故值此亂時，叛者皆說：“非裴黃門之罪。”既而宇文化及至，裴矩迎拜馬首，遂得免。
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