崇禎時轉戰各地，登州平叛、宣府禦敵、陝西“剿寇”，都能見到其身影，後助兄守錦州，崇禎十五年（1642年）隨兄降清，隸鑲黃旗。
祖大弼為人“有膽略，喜結客”，萬曆年間入寧遠衛學。
祖承訓去世後，祖大壽將父親分給自己那份的遺產給了祖大弼，祖大弼將其全部用來結客，得到許多死士。
天啟二年（1622年）遼西陷落之際，其兄祖大壽逃入覺華島，御史方震孺許諾讓他成為選貢，讓他勸說其兄來歸，後祖大弼投筆從戎，隨兄征戰，抵抗後金。
在崇禎三年（1630年）遵永大捷中立功，累遷黑莊堡都司。
崇禎四年（1631年）九月，他參與救援被困在大淩河城的兄長祖大壽，十六日交戰於錦州，據說差點生擒皇太極。
二十七日，明軍兵敗長山，祖大弼等逃走。
十月二十九日，祖大弼率高應元、陳二、韓五三人率一百二十七人劫營，以創造祖大壽來歸的機會。
崇禎五年（1632年），參與平定孔有德叛亂，在此期間升為副將。
翌年收復登州，論功行賞，祖大弼實授都督僉事，蔭外衛正千戶。
崇禎七年（1634年）七月，後金軍毀長城，進犯大同，擊敗曹文詔與祖大弼軍，略地至宣化，攻懷遠，設伏左城西，噶布什賢噶喇依按班圖魯什到宣府偵查。
遭遇祖大弼巡邏兵十五人，雙方展開激戰，明軍陣亡二人，十三人被俘虜，但是圖魯什也受重傷而死。
同年，馬世龍去世，祖大弼接任為寧夏總兵，並參與圍剿活動於陝西的李自成等部農民軍。
崇禎十二年（1639年），因張獻忠復叛，祖大弼又被調至湖廣，統兵千餘人，隨總理熊文燦圍剿張獻忠等部農民軍。
崇禎十三年（1640年），祖大弼被調至關外，助兄祖守錦州。
崇禎十五年（1642年），與祖大壽降清，編入鑲黃旗漢軍第三參領第六佐領。
順治時授散秩內大臣，並曾隨清軍出征。
順治十二年（1655年）其子祖澤潛登科時，被記錄為“慈侍下”，可知祖大弼此時已去世。
“身為祖大壽的弟弟，吳三桂的二舅，祖大弼自然也是跟著老哥共進退，松錦之戰後便降清了，不過祖大弼在降清之前的戰鬥中親手擊斃了滿清大將穆克坦。”王晨暗道。
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孔有德（身份：工學院畢業的學子）
武力值：95點
統帥值：97點
智力值：96點
政治值：77點
發明值：110點
技能一製作：孔有德在製作火器時，智力值提升5點，發明值提升5點，孔有德在研發新火器時，智力值額外提升5點，發明值額外提升5點。
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