太宗皇帝李世民屢賜藥膳，並遣中郎將留宿徵宅，日奏起居，至聞魏徵疾情加篤，親自問疾數次，且尚與談國事，或帶著太子承乾，教他親承師誨。
最後一次，且挈了季女衡山公主，同至魏徵榻前，指公主語魏徵道：“此女當嫁與卿子叔玉，卿能起視新婦否？”
魏徵已不能強起，流涕答謝，太宗皇帝亦為泣下。待挈女回宮，夜臥成夢，恍惚見魏徵入朝，做陛辭狀。
唐太宗醒來覺此夢未佳，待至天曉，即有人入報，魏徵已謝世，當下匆匆盥洗，即命駕臨喪，親視大殮，撫棺訣別，不覺失聲悲號。
唐太宗哭罷還朝，令太子李承乾舉哀西華堂，且詔內外百官，盡行赴喪，又賜給羽葆鼓吹，陪葬昭陵。徵妻裴氏道：“徵素儉約，今葬用羽儀，恐非徵志。”悉辭不受，但用布車載柩而葬。有此賢婦，可謂無獨有偶。太宗賜諡文貞，追贈司空兼相州都督，臨葬時登苑西樓，望哭盡哀。
既而自制碑文，併為書石，曾語侍臣道：“以銅為鏡，可正衣冠，以古為鏡，可見興替，以人為鏡，可知得失。徵歿，朕亡一鏡了。”
魏徵貌不過中人，獨有膽識，每犯顏進諫，雖遇太宗李世民盛怒，顏色不變，太宗李世民亦為霽威。嘗謂魏徵似疏慢，唯朕獨見徵嫵媚，所以言多見從。
魏徵歿後尚感念不已，尋命在凌煙閣中繪功臣像，共得二十四人，徵列第四。作者綜述如下：
長孫無忌、 趙郡王孝恭 、杜如晦、 魏徵、 房玄齡 、高士廉 、尉遲敬德 、李靖 、蕭瑀 、段志玄 、劉弘基 、屈突通 、殷開山、 柴紹、 長孫順德、 張亮、 侯君集、 張公謹 、程知節 、虞世南 、劉政會、 唐儉 李世積 、秦叔寶 。
這二十四人中，如杜如晦、魏徵、段志玄、屈突通、殷開山、柴紹、長孫順德、張公謹、虞世南、劉政會、秦叔寶十一人，已經去世，餘尚生存。
唯侯君集因破滅高昌，後，在未奏請太宗皇帝李世民的情況將一些沒有罪的人發配，又私自將高昌國寶物據為己有。手下將士們知道後也開始盜取金銀珠寶，侯君集害怕自己做的醜事被揭發，於是不敢治將士們的罪。班師回朝後，司法官將侯君集下獄，但中書郎岑文字以為侯君集是功臣大將，不能輕加屈辱，於是上書給唐皇帝李世民請求將侯君集釋放。 而侯君集自以為立下大功卻因為貪財而被囚禁，感到非常不快。
貞觀十七年（643年），張亮被派往洛陽都督，侯君集問張亮：“怎麼會遭到排擠？”
張亮說：“如果因為公務在外做官就是遭到排擠，那麼誰才是最冤枉的？”
侯君集又說：“我平定一個國家，回朝後惹得皇上大怒，怎麼不是排擠？”
侯君集說著還挽起袖子說道：“這樣子活不下去，你能造反嗎，要是可以，我和你一起造反。公與我交好有年，既與我氣誼相投，不願排我，我何妨實意相告。古人有言：‘狡兔死，走狗烹，敵國破，謀臣亡。’今我等具有戰功，也鬱郁不能自活，眼見得是兔死狗烹了。公試想來！應用何策求生。”
張亮將侯君集的話告訴給了唐太宗李世民，唐太宗皇帝李世民於是對張亮說：“你和侯君集都是功臣。這些話侯君集只告訴給了你一個人，到時候他死不認賬，你也拿他沒辦法。”
張亮即辭行赴任，仰承上意，暫守秘密。
於是太宗皇帝李世民將這件暫且放下，對待侯君集還是和以前一樣。而後太宗皇帝李世民命閻立本畫侯君集等二十四人的畫像置於凌煙閣，侯君集位列第十七名。
偏太子李承乾，已窺知侯君集怨望，私自引侯君集婿賀蘭楚石為千牛，官名。囑他邀入君集，密談衷曲。侯君集道：“魏王甚得上寵，若殿下不早為備，恐殿下將為隋楊勇了。”楊勇系隋文帝太子，為弟楊廣所譖，遂致廢死，事見《隋史演義》。
太子李承乾說道：“正為此事召公，欲公為我設法，免蹈楊勇覆轍哩。”
你若不要他設法？尚不致與楊勇一般。
侯君集道：“君集願為殿下效死。”說至此，又舉手語太子李承乾道：“有此好手，亦當為殿下指揮呢。”
恐你亦不懷好意。太子喜甚，厚贈侯君集。
侯君集即與太子李承乾密圖魏王李泰，偏偏天不助逆，疾病纏身，太子李承乾本有躄疾，至是加劇，竟致步履維艱，一時不便發難。
會東宮有一侍女，名叫俳兒，恣首甚佳，且善歌唱，不愧芳名。為太子李承乾所寵暱，日夕不離。足疾由此而生，亦未可知。
太宗皇帝李世民聞知此事，即召入俳兒，責她蠱惑太子，即加杖百下，俳兒竟重傷因是殞命。太子李承乾非常悼惜，且懷疑是由魏王李泰告發，致觸父怒，一念恨著魏王，一念記著俳兒，私為俳兒起冢苑中，朝夕祭奠，每至冢旁，輒徘徊泣下。
太子李承乾嗣是怨懟日深，按日里託疾不朝，但在宮中聚奴為戲，聊解愁悶。間或令宮奴盜竊民間馬牛，親臨烹炙，與一班嬖童寵婢，同坐而食，侑酒傳杯，備極諧媟。
有時酒後興酣，自易服作突厥衣飾，效突厥語言，命左右亦著胡服，以五人為一小部落，布氈為幄，分戟為陣，外豎五狼頭纛，內設穹廬帳舍，高坐堂皇，一呼百諾，命左右烹羔以進，自拔佩刀割肉，與眾共啖。啖畢，語左右道：“我已做過可汗，譬如今朝死了，汝等可為我行喪禮。”說至此，突然倒地，僵臥不動。左右一齊痛哭，跨馬環走，剺面做居喪狀。
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。了去而鬨一竟，言別無餘，基承幹紇捕捉詔奉言答騎緹，事何問驚乾承李子太
。安心覺稍子太，涉無子太與，基承連干，事佑王齊因謂，報儼安李經旋。附不魂得嚇幾，洩發經已，謀己自是道還，時此了到乾承李子太。峰奇外天彿彷
。獵遊好素，躁輕生，督都州齊領兼，王齊封，子七第民世李宗太本佑李。盡自令賜，人庶為佑廢詔有，京至執被佑李王齊，天幾到不。日數緩略，謀己自把好只也，嚴戒師京因但
。奪裁旨請，失過佑李陳乃，罪得並恐，從不諫屢，紀萬權史長
。名為側君清以，縣州各檄傳，役兵當充，丁壯募招面一，憤洩磔，紀萬權殺，謀逆定商，等亮弘燕客狎與遂佑李。朝紀萬權與佑李召，實得按往，威德劉書尚部刑令民世李宗太。人十數右左佑李劾彈且，去縱行盡犬鷹把，門國出佑李聽不，束管旁從紀萬權。戾暴益且，恨憤勝不佑李，責切詔手民世李帝皇宗太
。師京送佑執已，等敏行杜曹兵府齊，州齊至未尚，伐討往前詔奉積世李
：道嘆詩有。來起拘他把，人庶為乾承子太廢，下詔道一，洩被謀逆巧湊，來起懼惶些有復，念觀的悲狐死兔了存，乾承李子太。人十數坐連黨徒，死他將好只，恩私子父得不顧也民世李帝皇宗太
。難父作難非子作，看人後事行人前
。殘相屢骨何如，慎審宜謀貽識才
。知便章下看試，由廢被乾承知
。矣戒所知以可，者人古鑑善，世後箴以事往借，辭比事屬回本故？華中在況，安治謀而常綱捨能不猶，國之狄戎夫？乎咎辭能豈宗太。多已憾，間之弟兄子父然，延蔓致不，滅撲日早以得，唐佑尚天幸。禍大幾，逆謀外，親懿顧不等荷杜、節趙，子太逾惡佑王齊，兄無昌元，父無乾承至卒，俑作爾竟，倫自敢，嬙嬪做可妃王巢，骨戕自門武玄乃。敏英稱尤，君之見僅下代三為宗太唐，邦之文為號，義禮崇素國中若。矣見概可已，事厥突西敘之回本觀。者變不年十數有聞未，衰倏興倏而，人服力以，主之悍強有雖故，事常為亦逆篡，尋相報烝俗胡？下天平乎烏？國治乎烏，生必則，正不常綱，要大之平治為，常五綱三
