一月八日，週六
灰色的光芒閃籠罩的天空下，一個冷漠的聲音傳遞到全世界。
“圖書館那個女人走了，我終於可以看到你悲慘的死狀了，害我浪費四十億年時間的小賊！”
從美洲最高作戰會議室內的總統，螢幕上播出的最新科考隊直播畫面中的每一個成員都一個表情共同說道。
他們在灰色的城市廢墟抓住最近的灰人，人類軍隊原本變成了黑白照片的人中也有從定格成了一張畫的樣子迴歸的人。
只是他們卻找不到灰人。
奉風驚覺第一次衝擊後這個已經過了四十億年的世界的每一個人類都是莉莉私，雖然城市裡僅過了兩天，但是外界環境變化再大，他們的祖先也都是一個。
滅世者出手將新的世界觀打入這個世界內重置時間的手段不是為了什麼還原劇情，他改變人類的起源不只是要改一下劇情就行，而是要讓每一個人都成為扣動毀滅的扳機。
原來他到會議室在上首總統一無所知的表情下放下的一支筆被他從頭頂拿下。
滅世者盯著桌上寫著“這個本世紀最大的發現和巨大的商機……”的發言搞諷刺的捧腹大笑。
“這是人類歷史和超古代文明的聯合的滅亡，這個文明需要一切商品只有滅亡，而我們什麼都有並且能獲得回報，滅世者的回報，哈哈哈……”
十幾人的會議室中重要官員們如同表情一樣的機器人，在奉風閃身走出後，將他各種惡搞的痕跡指出，嘲諷的聲音響徹整個世界。
“啊哈哈你說不用開啟戰爭，不然下次拜訪我將取走你們的頭，傻眼了吧，你取不了了！”
奉風最後掃了一眼總統，明白過來叫石上流的灰人是滅世者安排的人，雖然總統的嘲笑十分刺耳，但是他還是忍不住慶幸自己沒有留下那個背判的灰人。
這時明明沒到時間，他的耳邊卻響起了日語的歌聲。
歌聲繞城不絕，他能傾聽著這首動聽的歌裡焦急的音色。
灰城出事了！
“世界は終わりを告げ，灰色……”
奉風聽著夏娃的歌閃回到灰城，見到了城市內除了葛城教授，其一行停滯的身體都活動了起來，並且抓著一個灰人。
在新世紀福音戰士的動漫中，第二次衝擊的場景被描繪為一場毀滅性災難，其影響遠超常規自然事件。
有描寫提到災難發生時，全球海平面驟升，地軸發生扭曲，導致生態系統劇烈變化。
同時，災難引發連鎖反應：沿海城市被淹沒，陸地地貌重組，氣候突變引發極端天氣頻發，全球人口銳減至原先的一半。
原本災難的觸發點常是南極區域。南極研究設施因實驗事故導致使徒暴走，引發能量釋放：天空被漆黑覆蓋，高溫蒸發河水，生物瞬間死亡，地面裂痕蔓延，類似核武器爆炸的視覺與物理效應發生。
如今，第二次衝擊卻發生在了灰城。
火光沖天、煙柱遮蔽天際，地面裂痕中湧出熔岩般的物質，建築物在高溫中坍塌。
巨響伴隨轟鳴聲，持續低頻震動穿透大地，生物哀鳴與機械轟鳴交織。
