然而，在這場平定叛亂的過程中，有一個問題始終困擾著清軍——吳三桂的屍骨究竟在哪裡？
為了找到這具關鍵的屍骨，清軍可謂是費盡心思，他們將昆明城掘地三尺，不放過任何一個可能的地方。
然而，儘管他們挖出了數百具屍骨，但經過仔細辨認，卻都不是吳三桂的。
這個謎團讓人不禁好奇，吳三桂的屍骨究竟被藏匿在了何處呢？
或許，只有郭壯圖、吳世潘、方光琛等極少數人知道這個秘密。
然而這些人已經死了，又去哪裡找呢？
大將軍彰泰眼見久攻不下，心中愈發焦躁，終於忍無可忍，決定對吳家採取極端手段。
他下令將吳家上上下下所有人都嚴刑拷打，企圖從他們口中逼問出吳三桂的下落。
在這殘酷的折磨下，吳三桂的一個小侄子最終承受不住，精神崩潰，吐露了真相。
原來，吳三桂早已被火化，而他的骨灰就藏匿在石橋的水底。
得知這個訊息後，彰泰如獲至寶，立刻命令士兵將湖水放幹。
果然，在乾涸的湖底，他們發現了一個骨灰匣子，經確認，這正是吳三桂的骨灰。
彰泰不敢有絲毫耽擱，立刻派遣專人，將吳三桂的骨灰匣子和吳世潘的人頭一起，以八百里加急的速度送往京城。
昆明城破，那京城的耿昭忠和耿聚忠也閒不下來了，因為他們知道，到了康熙要清算賬目的時候了。
耿昭忠、耿聚忠等人接連上書，彈劾耿精忠所犯下的種種罪狀。
這些罪狀包括叛國投敵、殘害百姓等等，樁樁件件都令人髮指。
康熙得知此事後，龍顏大怒，當即傳召耿精忠入京覲見，讓他當面對質，辯駁這些指控。
耿精忠接到聖旨後，心中憤憤不平。
他認為自己為清朝立下了汗馬功勞，如今卻要被康熙卸磨殺驢，實在是不公。
於是，他決定帶著自己的親信，包括那些同樣被彈劾的曾養性等人，一同入京，以證明自己的清白。
然而，耿精忠的如意算盤卻打錯了。
當他抵達京城後，等待他的並不是公正的審判，而是王大臣等議定的革去王爵、磔死籍沒的嚴懲。
不僅如此，耿精忠的父子以及曾養性、白顯忠等親信，也都難逃一死，被處以極刑。
康熙下令暫時將精忠關押在監獄裡，同時將他的家屬和部屬分別歸入正黃旗和漢軍旗下。
當昆明城被攻破的時候，康熙下達旨意，將精忠與曾養性、江元勳、劉進忠等總共九人一起，在菜市口處以斬首之刑，並將他們的首級懸掛示眾。
至此，福建的靖南王被徹底取締，福建地區再也沒有藩王存在了。
