建安十一年正月，曹操親自率軍攻破壺關，徹底消滅了袁紹外甥高幹的勢力，平定了幷州，北方的戰事越發的清晰。
荊州和淮南的壓力日益增加，雙方也開始採用不同的策略與曹操周旋。
劉表對曹操採取的是修好之策。他不停送使者和軍糧、財富與曹操結好，試圖將曹操的下一個目標轉向淮南。而曹操似乎也十分欣賞劉表的態度，特意擺出一副知己的樣子與其書信周旋，但明眼人卻知道，這只是曹操的緩兵之計。
而袁耀則實際的多。隨著江東刺殺案的結束，淮南進行了充分的輿論動員，開始集結部隊、籌集糧草，準備再次南下徹底掃平孫權在丹陽和吳郡的殘餘勢力，給自己一個穩固的後方。
行動之前，袁耀首先對合肥中樞進行了大刀闊斧的改革和調整。
他首先合併了原來的監察和考評兩司，組建了新的肅政司。肅政司下轄監察局、考評局，由閻象掛銜肅政司司長，諸葛瑾任副司長兼任考評局長官、閻象之子閻晨出任考評局長官。
但由於閻象身體一直不好，具體事務便由諸葛瑾負責。大家也都是清楚，肅政司司長這個位置早晚是諸葛瑾的。
合併監察司和考評司，使得這個新的肅政司權力大增，終於和內政司達到了平起平坐的地位。
這便是合肥刺殺案的影響之一。
內政司實在是過於龐大，雖然有考評司和監察司給予約束，但還是無法做到對等。以至於內政司丹陽政務處出了這麼大的漏洞，導致一千兩百名江東刺客大搖大擺的潛入合肥行刺。
監察司只管不法事，那些官員只要做事時迴避淮南律法便不怕。再加上監察司官員大多不懂政事，使得他們發現內政司各局貪汙、瀆職的證據極難。
而考評司雖然精通政事可以發現問題，但卻沒有監察之責，自然也不會越俎代庖去揭發什麼罪行，所以雙方一直都沒有任何的配合。
現在兩司合併，同時手握考評和監察大權，內政司便有了個真正的對手。
隨後袁耀便向軍事機構下手！
他撤銷了兩軍都督府，將參謀司合併組建了一個新的五軍司。這樣，大都督、左右都督便成為了榮譽的官職名稱，不再有具體實權。
新建的軍務司主要負責作戰計劃制定、調兵和各鎮軍力的編制以及軍官升遷。具體的作戰、訓練，由各鎮總領負責，而各鎮總領卻不歸五軍司直接統領，而是直接向中樞臺負責。凡各鎮調動或進行軍事行動，必須有軍務司的正式作戰命令以及袁耀的授權才能成行，這便限制了各鎮獨立運作的能力。
袁耀任命江軒為五軍司司長，龐統為副司長兼任軍師祭酒，成為了袁耀身邊的首席智囊。
袁耀認為此次淮南的內部動盪，以及淬劍莊派系葉樂安的叛變，從客觀上與他多年的過分縱容有關。他對淬劍莊的嫡系缺少防範之心，沒有一視同仁的進行多番考核。
葉樂安既然能夠叛變，那麼難保其他淬劍莊之人便不會。多虧了葉樂安只是一個稽查處長官，萬一要是在外邊統兵的將領，後果將不堪設想。於是袁耀下決心用更加完善的制度，杜絕這種事情。
衛軍中除了黃漪的汝陽衛、紀靈的懷遠衛、陸遜的綏寧衛以外，其他的衛軍都是一色的淬劍莊體系，而且這些淬劍莊體系的衛軍，是淮南絕對的主力。
他必須增加軍隊中，非淬劍莊系統的隊伍比例才行。
於是袁耀將目光轉向了原本的護軍，他將袁明從內政司訓導局調離，令他單獨建立五營護軍，統稱為五軍營，增強中樞的軍事力量！並將雷緒父子所統帥的護軍，重新整編，命名為西軍營。
現在淮南各衛軍的編制之下便是營，除了宣武衛有一萬人以外，其他的衛都是五千人編制，而獨立作戰的營級編制有兩個，一個是李義、侯暉的先登營、另一個是潘璋的選鋒營。
袁耀認為這種營級單位不錯，三千人也容易管理制約，並且不會出現什麼叛亂風險，所以準備大力發展。
新建的五軍營共計一萬五千人，分為東南西北中五營，隸屬於白翠微的淮南鎮節制，屬於中樞軍隊。
五軍營所有官員都從各軍非學院派系的老兵中提拔而出，預計一年建成。袁明出任淮南鎮副總領，下面五營各設獨立營官。
袁耀準備用他們來平衡學院派在軍事系統中的力量。
這便是合肥刺殺案帶來的影響之二。
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