三，絕口不提林川是他女婿，完全以公事公辦的口吻請罪。
茹瑺這一請罪，既盡了兵部主官的職責，又避開了翁婿干係的嫌疑，盡顯洪武老臣的沉穩分寸。
一個女婿半個兒，險些被殺的是茹瑺的女婿，朱元璋自然不會遷怒他。
瞥了茹瑺一眼，朱元璋怒火稍斂，沉聲道：“失察之罪暫且記下，即刻擬旨。”
“此案，以通倭謀逆、謀殺風憲官定罪，按《大誥》從重處置，破律立威，以儆效尤！”
朱元璋口傳諭旨，字字殺伐決斷，由翰林院當場筆錄。
“其一，登州衛指揮使賈峰為主謀，造意謀殺風憲官，按律本當處絞，然其通倭叛國、罪大惡極，著即凌遲處死，剝皮實草，首級傳示沿海九衛所，以警邊將！”
“其家屬成年男子盡數處斬，婦孺流放三千里，削除軍籍，家產抄沒入官！”
“其二，涉案走私黨羽、衛所軍官，一律梟首示眾，削除軍籍，永世不得入伍；協同偽造倭亂、知情不舉者，發遼東充軍，永不赦回！”
“登州衛鎮撫等官吏，失察縱奸，全數革職拿問，重者斬首，輕者流放，徹查登州衛！”
“其三，遣錦衣衛緹騎星夜趕赴登州，鎖拿逆犯入京，督辦行刑，當眾公示，讓天下人都知曉，通倭害官的下場！”
“登州防務暫由僉事戚斌署理！按察副使林川領銜徹查全案，兼查登州衛軍政風紀！”
此事最被朱元璋以通倭、謀殺風憲定性，按謀反同論的政治重罪辦理，形成全國性震懾案例。
登州衛也遭到了毀滅性的大清洗。
主官革職處死，僚屬降調充軍，中下級軍官全面甄別，涉案者軍法從事。
就連負責內部監察的鎮撫使也被論罪。
這還沒完，朱元璋增設登州衛監察專員，首屬都察院，強化風憲監察權；衛所軍官司法案件，歸按察司主審，五軍都督府不得干預，確立軍政互監之制。
後續兵部也制定了一系列的處罰。
登州衛番號保留，人員全盤重組，調內地精銳輪戍，軍餉軍需改由戶部首供，徹底切斷衛所走私利益鏈；
山東沿海海禁加嚴，民船盡數查禁，軍船編號管制，出海須雙印勘合；違者梟首，鄰里連坐。
山東沿海衛所全面整肅，換防將領、核查軍籍、清點軍備，沿海巡檢司增兵增哨。
兵部還出臺“防倭十事”等專項榜文，將“通倭走私”與“謀反”同列，鼓勵軍民告發，重賞舉報者。
一場登州之變，最終成了洪武朝重典治國的標杆大案。
林川也萬萬沒有料到，自己孤身破局的一樁差事，竟會掀起席捲朝野的滔天波瀾，留下橫貫大明的深遠影響。
訊息順著驛道傳遍山東全境，各級文武官吏噤若寒蟬，人人自危。
此前尚有官員輕視風憲官、暗中敷衍監察，此刻無不收斂行徑，按察司的權威空前拔高，洪武朝“以猛治國、重典懲奸”的鐵律，徹底刻進了每一位官吏的骨子裡。
沿海格局更是天翻地覆，山東沿海的走私貿易一夜絕跡，膽大的海商被迫轉入地下蟄伏，倭寇失去了衛所內應的眼線與接應，沒了陸上靠山，短期內不敢貿然竄犯登州海域，沿海百姓總算迎來片刻安寧。
登州衛乃至整個山東沿海的軍心也隨之劇變，涉案貪腐軍官被清剿一空，剋扣軍餉的陋習連根拔除，士兵糧餉足額髮放、地位小幅提升，對朝廷的忠誠度大幅強化。
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