隨後半個多月，班第借勢雙管齊下，既清剿藏地反動餘孽，亦讓新軍借實戰磨鋒。
新軍分赴山南、阿里等地，頂風雪挨村排查。
士兵在村寨地窖揪出密謀串聯的叛土司謀士，於阿里深谷追三十里擒獲叛亂骨幹，數日內拿下餘黨數千人，起獲私藏火繩槍與反清文書。
經此搜捕，士兵熟稔了藏地高寒山地地形，實戰配合愈發默契，漸成鎮藏鐵拳。
同時，班第親赴前藏格魯派核心寺院，將查獲的土司與寺內下層僧人私通訊件擲於堪布面前。
“達賴喇嘛受朝廷冊封護眾生，爾等若容僧人勾連亂黨，本將必查至寺根！”
堪布們面色凝重，忙遣人稟報七世達賴。
次日，達賴便傳下法旨：“各寺嚴守清規，不得干預俗事，涉亂僧人即刻逐出，永不得返寺。”
轉往後藏札什倫布寺，五世班禪己率寺內活佛等候。
見班第身後軍容嚴整，先嘆一聲。
“珠爾默特叛亂，擾得後藏商路斷、牧民慌，大人平亂是救藏地。”
班第順勢提議：“後藏部族糾紛，煩請班禪與朝廷共商調處。
朝廷在日喀則至阿里要道設卡，既護商路，也防餘孽流竄。”
班禪當即應諾，隔日便派親信高僧隨新軍入村，以“佛法戒妄動，順法度得安穩”宣講，那些曾附逆的小部族頭人，紛紛主動向駐藏大臣衙署報備動向。
世俗政務上，駐藏大臣傅清召全體噶倫議事。
數名與頗羅鼐有舊的噶倫剛以“部族慣例”辯解，見帳外清軍按槍而立，頓時語塞。
傅清當場罷其職務，提拔新軍中出身貧苦、靠軍功晉升者接任，擲下新規。
“自今日起，藏區戶籍編查、賦稅收繳、商路管理、部族糾紛、寺院事務監管等要務，須有駐藏衙署簽章方可推行。
軍隊調遣、邊防佈防，及各地藏兵（含舊藏軍餘部）的整編操練，由駐藏衙署統籌節制！”
餘下噶倫聽罷，或低頭捻著袖口，或偷瞄帳外持槍肅立的新軍，再無往日因貴族身份而起的倨傲。
其中一位出身山南小部族的噶倫，率先躬身拱手。
“駐藏大臣所定規制，既合朝廷法度，也安藏地人心，我等遵令。”
其餘人見狀，也紛紛垂首應和：“願依新規辦事，絕不敢擅越。”
傅清將眾人神色盡收眼底，心中門兒清，這些噶倫多是舊貴族出身，祖輩攥了百餘年的特權被生生剝去大半，面上恭順，心裡不定翻著多少怨氣。
尤其是剛被罷免那幾家的旁支，雖沒敢作聲，眼底的陰翳卻藏不住。
但他毫不在意，只緩緩抬手示意議事結束。
“新規既立，三日後各司履新，衙署會派人督查。
若有陽奉陰違、私傳舊權者，休怪本官鐵面無情。”
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