李自成當時並沒有為難崇禎帝的皇子們，不僅邀請三位皇子共同進餐，甚至還答應了太子朱慈烺提出的不可驚擾祖宗陵寢，禮葬父皇母后，誅殺不忠不義的投降官員等三個請求，還被李自成封為宋王。
太子朱慈烺，被李自成抓住，隨軍出征，山海關大戰後下落不明。
順治元年，清廷抓住皇太子，但一時真偽之說各異。第二年，清廷詔告天下，稱是偽太子，旋即處死。這一年也是南明弘光元年，在福王的朝廷也出現了一位皇太子，同樣真假莫辨，成為轟動一時、牽動政壇的大案，最後弘光朝廷以該太子是明驗馬都尉王昺之孫王之明假冒而終了此案。
清兵攻陷南京後，該太子被押送北京，後被匆匆處死。南北皇太子之真偽是一樁公案，但另一方面，自此以後，皇長子就退出了歷史舞臺，人們將目光集中在剩下的兩位皇子，特別是三皇子身上，這就是人們常說的朱三太子。
一些史料曾說，他在逃跑後，出家做了和尚，並且民間多次以朱三太子的名義，進行起義活動。
順治年間已有人以此為旗號，以對抗清廷。順治十二年，有朱國琪者，稱朱三公子，在蘇北組織反清活動。第二年，也有人自稱是崇禎三子，亦欲舉事抗清。
康熙十二年十一月二十一日，吳三桂起兵反叛，一個月後，康熙才得確切訊息。然而就在同一天晚上，就在康熙所在的京師，一場打著朱三太子的旗號的起義正在謀劃之中。
楊起隆利用八旗主奴、主佃之間的尖銳矛盾，發展了以八旗奴僕、佃戶為主的隊伍約有千人，他自稱朱三太子，建年號廣德，起義者稱中興官兵，以頭裹白布、身束紅帶為標誌，定於十二月二十三日五更時分同時在京城內外，放火舉事。後因訊息洩露，楊起隆提前在二十二日匆忙起事。
對於這起朱三太子事件，康熙極為震驚，為緝拿朱三太子和起義者，關閉京師九門，獲賊既多，斬頭無地，以車滿載出九門斬之，屍積如山。如是者八日！
康熙十九年，在陝西、漢中一帶拿獲一持安國大將軍印、自稱朱三太子者，此人自稱是楊起隆，原名叫朱次門，康熙卻認為，他是假太子，且是假楊起隆，託名造反而已。
康熙二十一年，楊起隆的舊部王建中在陝西抗清被捕。
康熙年間，除了楊起隆案外，還有其他的朱三太子案。
康熙十六年，福建漳州人蔡寅詐稱朱三太子，糾集海上兵勇，皆頭裹白布，稱白頭軍，與臺灣鄭經聯合，後被海澄公黃芳世擊敗。
康熙十八年，安親王嶽樂在湖南新化縣的一座寺廟裡，抓獲了一名叫朱慈燦的人，自稱是明朝太子，後康熙斷定是假太子。
康熙三十八年，康熙第三次南巡，他親自祭奠明太祖的孝陵，見到陵寢傾圮過甚，認為是無人專司其職所致。
康熙觸景生情：“朕意欲訪察明代後裔，授以職銜，俾其世守祀事。”
這無疑表明康熙要善待明之後人，自然包括朱三太子，只是地方官以雖經查訪，亦難得實為詞而作罷。
其實，真正的三皇子朱慈炯，在李自成兵敗後，就不知所蹤了。
至於四皇子朱慈炤，同樣在李自成兵敗後，流落民間。
後來，他被一位前朝王姓官員收留，並改名為王士元。之後，他便以教書為生，娶了一妻一妾，並育有六子三女。
康熙四十七年，朱慈炤已經以王士元的身份，活到了七十五歲。當時有人注意到，他為兒子取名時，以朱家的和字排輩，並且，當時正好有人打著朱三太子的旗號造反。這就導致朱慈照最終被嚴查後抓捕。
儘管朱慈炤被捕後，多次辯解自己從未行謀反之事，而且對清朝還心存感激，要謝三大恩：所謂滅流賊，雪君父仇；凡我先朝子孫，從不殺害；皇上躬行祭掃先朝祖宗墳墓。但康熙並未手下留情，還是認定是假冒。
這位四皇子是真是假，不重要。此案刑部有判語：“朱某雖無謀反之事，未嘗無謀反之心，應擬大辟，以息亂階。”
這說出了康熙的心裡話。
康熙以他未嘗無謀反之心，並且以假冒前朝皇子的罪名，將他滿門抄斬。
當時，為了證明四皇子朱慈炤是假冒的。清廷把他與五皇子朱慈煥混為一談。說這個四皇子早已夭折，不可能還有什麼四皇子。所以，民間出現的這個四皇子朱慈照顯然是假冒的。
不過後來，乾隆時期清廷官修《明史》時，又重新記載，說朱慈炤是四皇子，而五皇子朱慈煥早夭。
總之，歷史上崇禎帝的後代到底如何，無人知曉，且有多種說法。
。娘姑小的扮打人任是歸終，史歷
