再然後精靈王阿爾弗烈德開始對人類發動戰爭，並舉行了升騰者儀式，間接導致了精靈王國的衰亡。這也被普遍認為是第二紀結束的標誌性事件之一。
在這過程中，太陽女神在幕後引領了整場戰爭，自己則很少出手，中間不斷有大量其他神靈捲入。一直持續到星空外神第三次入侵為止。
整個第二紀的歷史極其混亂，沒有任何引領者出現，也被稱為是灰暗年代。
從一開始，太陽女神就洞悉了瓜拉尼兩個分身的真相，死神和鍊金與工匠之神實際上都是瓜拉尼的分身，當普通神靈成就正神時，都會得到世界的認可，得到些許世界本源的反饋。
瓜拉尼創造出兩個分身，讓分身晉升成正神，當三位正神重新三合為一，這也是晉升舊日的一種途徑。
但太陽女神留意到瓜拉尼忽略了一點，擁有三個正神層次的身體不但意味著力量和層次能夠快速增長，在本身就遭受汙染的情況下，更意味著知識瘟疫的疊加。
從始至終給瓜拉尼的選擇只有一個，那就是和祂的分身一同遠離這場神戰，明哲保身。
但太陽女神並沒有給瓜拉尼任何機會，隨著神戰的加劇，瓜拉尼以及兩個分身身上的知識汙染不可避免的加深了，而太陽女神則在此時入場，她在一場神戰中用永恆聖釘釘死了死神尤克基爾；同時放任她的盟友，當時已經和生命女神交換了身份的阿格尼絲吞噬了工匠與鍊金之神，獲取了創造權柄。
最後輸掉了整場神戰，僅剩光桿司令的瓜拉尼不得不留下了後手，在沃特斯古城選擇了沉眠。
詛咒神教，工匠與鍊金教會成為隱藏教派，知識議會退出正神教會行列，選擇了中立。
第二紀的最後，星空外神再次入侵。
儘管因為在第二紀，眾神們讓天啟世界推離了星空，這一次星空外神並沒能以本體入侵，但仍有大量陰綠色的隕石從天而降，變成了一個又一個扭曲的怪物，祂們有三個腦袋和八條手臂，背部長著如同蝸牛一般的甲殼。實力相當於一位正神。迫使眾神們不得不重新聯手，付出了極其慘烈的代價後才勉強獲勝。
而在這次入侵結束後，阿格尼絲的汙染越發嚴重，不得不選擇第二條路，徹底放棄原來的身體，選擇陷入沉睡。
畫面再次出現了一行文字：
第二紀正式結束
就此，第二塊和第三塊拼圖正式完成。
接下來劇情有所快進，歷史的長河快速流逝，一段段或熟悉，或陌生的節點匆匆流轉。
接著是第三紀，七大正神教派逐漸陷入了相對平衡的時期，眾神們逐漸不再踏足人間，轉而以尋找代理人的形式進行另一種形勢的神戰——宗教戰爭。
在這個階段，湧現出了大量人類的聖者，神話生物開始消亡，甚至淪為人類的超凡材料。
詛咒教派成為最大的隱秘教派後，一直在人類世界製造災難，試圖引導死神的迴歸。正神教會中，苦修教派，戰神教會和大地女神教會逐漸壯大，被稱為御三家。
再然後是布萊斯頓王國滅亡法裡克王國，布萊登雷澤家族滅族，戰神教會西遷。
而就在這時候，彈幕上提前飄起了大量彈幕：
“666，我韋恩大佬終於登場了。”
“恭迎韋恩大佬！！”
“這時候我老公看起來好青澀啊！”
錦瑟精神一振，隨後看到了在一場詛咒教派舉行的獻祭中，出現了一張熟悉的臉龐。恍然間，她有一種正在經歷歷史，創造歷史的厚重感.
