除此之外，但凡向許敬宗送上厚禮的武將、官員，他修史時一律隱去過失，大肆誇讚功績。高句麗之戰，龐孝泰率軍作戰，全軍慘敗，損兵折將，本是戰敗之將，龐孝泰重金賄賂許敬宗，許敬宗便在史書中改寫戰事經過，將其塑造成奮勇殺敵、勞苦功高的名將；尉遲敬德之子迎娶許家女子，許敬宗為尉遲敬德立傳時，盡數抹去其居功自傲、衝撞官員的諸多劣跡，連太宗當年親筆賞賜長孫無忌的文章，都被他擅自修改記載，寫成賞賜尉遲敬德，刻意抬高親家聲望。
這般肆意篡改正史的行為，在古代文人眼中是十惡不赦的重罪。史官承載記錄一代興衰、留給後世真相的職責，曲筆篡改等同於欺騙後世，士林對此深惡痛絕，可許敬宗手握官方修史許可權，當朝無人能夠制約，諸多不實記載留存史書，多年後劉仁軌等人重新整理國史，才大量刪改修正，可許敬宗曲筆留下的罵名，再也無法抹去。
貪財聯姻、曲筆修史兩大汙點，足以讓許敬宗名聲掃地，但真正讓他躋身朝堂核心、徹底改變初唐政治格局的，是永徽六年爆發的廢王立武大案。這場風波之中，許敬宗押上全部仕途，堅定站在高宗與武昭儀一方，對抗以長孫無忌為首的全部元老重臣，一躍成為帝后心腹宰相。
永徽年間，王皇后無子，高宗寵愛武昭儀武則天，想要廢黜王氏，改立武氏為皇后。訊息傳出，朝堂元老集體強烈反對，長孫無忌、褚遂良、韓瑗、來濟四大託孤重臣輪番進諫，直言武則天曾侍奉先帝，身份尷尬，萬萬不可冊立為後，褚遂良甚至在大殿之上以頭撞柱，血流滿面，拼死阻攔，李治屢次被重臣駁斥，進退兩難，心中壓抑許久的不滿日益加劇。
彼時文武百官大多觀望局勢，一邊是手握兵權、根基深厚的長孫無忌集團，一邊是心意已決的年輕帝王，沒有人敢公然站出來支援廢后，生怕站錯隊伍萬劫不復。許敬宗卻一眼看透局勢核心：廢后一事，表面是後宮嬪妃更替，實則是李治想要奪回朝政大權，擺脫關隴勳貴集團的控制。長孫無忌是皇帝親舅舅，卻處處制衡皇權，李治內心早已積怨，武則天聰慧有謀，若能借此機會助力帝后，便是獨一無二的從龍之功，未來權勢不可限量。
權衡利弊之後，許敬宗主動充當帝后朝堂喉舌，四處遊說百官，公開宣揚支援廢王立武的言論，最著名的一番說辭流傳至今：“田舍翁多收十斛麥，尚欲易婦；況天子欲立一後，何豫諸人事而妄生異議乎？”意思十分直白，鄉下農夫多收幾石麥子尚且想著更換妻子，天子想要冊立皇后，是帝王家事，外人憑什麼無端阻攔、妄加議論。
這番話通俗直白，精準戳中李治內心痛點，將元老重臣的勸諫定義為干涉帝王私事，極大動搖了觀望官員的立場。武則天暗中派遣心腹賞賜許敬宗金銀財物，李治也對他愈發信任，許敬宗不停在朝堂內外奔走，拉攏中層官員，不斷向皇帝上書，羅列廢黜王皇后、冊封武昭儀的合理性，分化長孫無忌一派勢力。
永徽六年九月，李治不顧群臣反對，下詔廢王皇后、蕭淑妃為庶人，打入冷宮；同年十一月，正式冊封武則天為皇后，廢后風波塵埃落定。全程奔走吶喊、出謀劃策的許敬宗，立刻得到豐厚回報，官職接連升遷，顯慶元年，授太子賓客，不久拜侍中，正式躋身宰相行列，同時保留監修國史職權，封高陽縣郡公，高宗甚至特許他可以在武德殿西側偏房隨時等候召見，參與核心機密商議，聖眷遠超一眾老臣。
站穩宰相之位後，許敬宗順著帝后心意，持續清理前朝反對勢力。他率先上書，請求削除王皇后、蕭氏家族全部官爵，流放其親族；緊接著進言，現今太子李忠乃是王皇后收養，身份尷尬，心中必然不安，建議廢黜李忠太子之位，改立武則天親生兒子李弘為儲君，穩固國本。李治採納提議，將李忠降封為梁王，外放房州，冊封李弘為新太子，徹底斬斷關隴集團借東宮制衡皇權的渠道。
此時朝堂之上，長孫無忌、褚遂良等人依舊擁有極高聲望，只要這些元老尚存，帝后依舊無法完全掌控朝政，剷除長孫集團，成為許敬宗下一階段核心任務。顯慶四年，一樁普通官員結黨案爆發，成為清算長孫無忌的導火索。
洛陽官員李奉節上書，告發太子洗馬韋季方、監察御史李巢結黨營私，李治下令許敬宗、辛茂將一同審理此案。許敬宗抓住千載難逢的機會，單獨提審韋季方，嚴刑逼供，強行誘導韋季方供認與長孫無忌勾結，意圖謀反。韋季方不願憑空誣陷太尉，絕望之下當庭自刺，重傷未死，許敬宗趁機上奏，稱韋季方畏罪自殺，足以證明長孫無忌謀反屬實。
李治起初尚且猶豫，不願直接處死親舅舅，感慨道：“朕不忍處置元舅，後世史官會如何評價朕？”許敬宗當即引述漢文帝誅殺舅舅薄昭的典故，勸說帝王大義滅親，謀反乃是動搖江山的重罪，不能顧及私人親情，若放任長孫無忌，他日起兵叛亂，皇室將萬劫不復。一番層層遞進的說辭，打消李治心中所有顧慮，下旨剝奪長孫無忌一切官職封地，流放黔州，其子侄全部革職流放嶺南。
為杜絕後患，許敬宗奉旨前往黔州複審長孫無忌謀反案，抵達流放之地後，逼迫長孫無忌自縊身亡；褚遂良早已被貶潭州，不久後鬱鬱而終，韓瑗、來濟等當初反對廢后的大臣，盡數羅織罪名流放偏遠蠻荒之地，朝中關隴勳貴勢力一夜之間土崩瓦解，再也無人能夠制衡李治與武則天，而許敬宗，便是這場大清洗最鋒利的一把刀。
清算完所有政敵之後，許敬宗權勢達到人生頂峰，顯慶三年，升任中書令，即右相，手握中書省最高行政權力，朝廷所有詔令、官員任免商議皆需經過其手，兼修國史、監管圖書典籍，軍政文務大權集於一身，朝堂之上無人能與之抗衡。
身居相位、爵封郡公的許敬宗，晚年生活極盡奢靡張揚，宅邸修建得富麗堂皇，裝飾奢華，家中歌姬侍女數以百計，時常舉辦盛大宴席，邀請百官赴宴，揮霍無度，俸祿、皇帝賞賜、聯姻賄賂得來的金銀堆積滿屋，對錢財的渴求至年老絲毫沒有收斂。
除了早年將女兒遠嫁嶺南蠻酋換取彩禮之外，許敬宗在子女婚嫁之上，全程以利益為先，只要對方能夠贈送重金，完全不計較門第品行。他為兒子許彥伯迎娶尉遲敬德孫女，收取鉅額聘禮，轉頭就在史書之中美化尉遲一族；但凡有官員想要家中子弟與許家聯姻，必先奉上豐厚財物，一時間朝堂之中，人人皆知許相賣兒女換金銀，士林鄙夷之聲從未斷絕。
比貪財更令朝野譁然的，是許敬宗自家爆發的驚天醜聞，這件家事甚至驚動高宗，成為滿朝文武茶餘飯後的談資。許敬宗年老之後，寵愛家中一位年輕侍妾，名叫虞氏，對其百般縱容。可他的長子許彥伯，常年出入內宅，竟與這位庶母虞氏私通，私情敗露之後，許敬宗震怒不已。
尋常官員遇上這般家門醜事，大多私下遮掩，低調處置，保全家族臉面，許敬宗行事完全反其道而行之。他絲毫不在意家醜外揚，直接將兒子與侍妾私通的全部細節整理成文，寫成奏摺遞交給唐高宗，主動揭發自家醜聞，請求朝廷嚴懲兒子。高宗看過奏摺十分震驚，只能依照律法，將許彥伯流放至嶺南蠻荒之地，虞氏被逐出府邸，永不復用。
堂堂當朝宰相，將母子穢亂內宅的醜事主動上報天子，任由百官議論，絲毫不在乎家族聲譽，當時眾人皆無法理解其行事邏輯。有人評價他冷酷無情，為了自身清譽，不惜犧牲親生兒子；也有人認為，許敬宗深知自身早已汙點滿身，再多一樁家醜也無法讓名聲更差，不如主動上交朝廷，展現自己大公無私、不徇私情的姿態，博取帝王信任，鞏固自身相位。無論出於何種心思，這件醜聞再度坐實世人對他“家風敗壞、毫無禮法”的評價。
龍朔二年，許敬宗已七十八歲高齡，年老體衰，精力不足以持續處理繁雜政務，上表向唐高宗請求致仕，告老還鄉。李治感念他數十年陪伴東宮、輔佐帝后、平定朝堂勳貴集團的巨大功勞，沒有直接准許他完全辭官，下旨授予特進高階散官，依舊保留俸祿、朝會資格，但凡國家重大商議、修撰典籍事宜，仍可入宮參與商議，恩寵依舊不減。
致仕之後的兩年間，許敬宗安享榮華，高宗時常賞賜絲綢、珍寶、肉食，多次派人前往府邸探望。
咸亨三年，西元672年，八十一歲的許敬宗在家中病逝，走完橫跨隋、唐兩代的漫長一生。
得知許敬宗去世訊息，唐高宗十分悲痛，為其廢朝三日，停止朝堂議事以示哀悼，下詔追贈開府儀同三司、揚州大都督，特許靈柩陪葬唐太宗昭陵。
陪葬昭陵是初唐臣子至高無上的榮譽，房玄齡、李靖、尉遲敬德等開國元勳才有此待遇，足以證明李治一輩子感念許敬宗的助力，全然不在乎朝野對他的負面評價。
風光下葬之後，朝堂再起風波，一場諡號之爭，將許敬宗一生功過矛盾徹底擺上檯面，成為後世評判他的關鍵佐證。
古代大臣離世，朝廷會根據一生品行功過議定諡號，一字或兩字概括其人一生，流傳後世，是文人官員身後最重要的蓋棺定論。許敬宗死後，太常寺負責擬定諡號，博士袁思古綜合其一生劣跡，擬定諡號為“繆”。
按照古代諡法，“繆”字代表名實不符、品行邪僻、言行虛偽，是極惡的差評諡號。袁思古給出理由清晰直白，全部取自正史記載的真實事蹟：許敬宗江都兵變屈膝求生，失臣子氣節；國喪之時取笑同僚，無禮失儀；收取重金嫁女蠻夷，貪財無度；執掌國史肆意曲筆，公報私仇；構陷長孫無忌等忠良，殘害元勳；家中子女穢亂內宅，家風崩壞，一生過錯數不勝數，配“繆”字當之無愧。
這份諡號公示之後，許敬宗的孫子許彥伯（此時已遇赦從嶺南返回長安）當即上書朝廷，激烈反駁太常寺的評定，控訴袁思古與許家有私人恩怨，刻意惡意詆譭先祖，請求朝廷重新召集官員商議，更換美諡。
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