劉子勳登基後，果然獲得各地宗王、方鎮的支援效忠，使得宋主劉彧政權的號令，不出建康城外的百里之地。更險惡的是，劉子勳與各方鎮都譴責劉彧篡位自立，紛紛出兵從四面八方討伐建康。當時宋主劉彧的弟弟們都在中央，支援劉彧即位；孝武帝的兒子們（劉子勳的弟弟）則多在地方，支援劉子勳（他們都不滿十歲，實為典籤掌權），這樣形成文帝系與孝武帝系內鬥的局面，，史稱“義嘉之難”（因為幾乎全國各地都使用劉子勳的年號義嘉）。
用鄧琬為尚書右僕射，張悅為吏部尚書，袁顗為尚書左僕射，此外將佐及諸州郡官吏，各加官進爵，賞賜有差，四方貢獻，多歸尋陽。
宋主媟只保有丹陽、淮南數郡，幾乎危急得很，亟派建安王劉休仁，都督征討諸軍事，命王玄謨為江州刺史，做了劉休仁的副手。
沈攸之為尋陽太守，率兵萬人，出發屯守虎檻。劉休仁等出都西去，才隔數日，忽然由東南傳來警報，說是會稽太守尋陽王等，已進兵至永世縣。永世縣地隔建康，不過數百里，都下震懼，風鶴驚心。
泰始二年（466年）二月，各地的貢品和報表都送到了尋陽。宋明帝劉彧的勢力範圍只剩下丹陽、淮南等幾個郡，而這幾個郡中又有很多縣起兵響應劉子勳。東線揚州方面的叛軍已經到了永世（江蘇溧陽），建康皇宮危在旦夕。
在這人心惶恐的時刻，宋明帝劉彧召集大臣商討成敗的大計。蔡興宗說：“現在普天之下幾乎同時背叛了朝廷，就是朝廷內部，也有人不堅定。我們應該鎮靜，以誠信待人。叛臣的家屬大多分佈在朝廷任職，倘若繩之以法，建康政權將會土崩瓦解，應該強調父子、兄弟、親戚之間，叛亂者不株連到家屬的道義，只要規定明確，心向建康的人才有鬥志。我六軍勇猛，武器精良，以這樣的部隊對付那些還沒有經過訓練的叛賊，其優劣之勢相差萬倍，請陛下不要憂慮。”
宋明帝劉彧連聲稱善，依議施行。
甫越兩日，又聞豫州有附逆訊息。豫州刺史殷琰，家屬多在建康，本不願歸附尋陽。建武司馬劉順勸說豫州刺史殷琰響應尋陽政權。殷琰因家屬在建康，沒有同意。右衛將軍柳光世從朝廷逃出來，投向薛安都時路過壽陽，他對殷琰說：“建康必定難守”。殷琰見對方是從建康逃出來的人，馬上相信了。此時殷琰名為豫州刺史，可是他沒有實權，其部屬都投靠著各種勢力，他自己還受當地的豪族、前任右軍參軍杜叔寶等人的牽制，就這樣，他也投靠了劉子勳。殷琰任命杜叔寶為長史，內外一切軍政事務，都由杜叔寶處理。
宋主劉彧又復添憂，仍召蔡興宗等入宮商議，蹙然與語道：“各地的叛亂還沒有平息，殷琰又起兵附逆，近日民情如何？事情能好轉嗎？”
而蔡興宗堅如磐石地說：“誰是叛逆，誰是正統，我不必分辨。現在商業中斷，糧食庫存量大，米價便宜。四面各地雖然騷亂，而民心反而更加安定。由此推算，蕩平叛亂必定能成功。但是，我所擔憂的是未來，正像西晉名將羊祜所說的：既平之後，方當勞聖慮耳。”
意思是奪取政權容易，鞏固政權難，要劉彧作好充分的準備。宋明帝劉彧聽完蔡興宗這番高論，有些似信非信似的說道：“誠如卿言，且卿前言叛黨親屬，不宜株累，朕今擬厚撫琰家，卿以為何如？”
蔡興宗道：“這正是招攜懷遠的要策呢。”
宋主劉彧遂令侍臣慰撫殷琰家，令他作書招收殷琰。並派遣兗州刺史殷孝祖甥荀僧韶，往諭孝祖，飭令即日入朝。
荀僧韶到了兗州，謁見殷孝祖道：“景和兇狂，開闢未聞，今主上夷兇剪暴，再造河山，不意群迷相煽，搖動眾聽。假使天道助逆，群兇逞志，亦必至禍難百出，不堪復問。舅父少有大志，若能招集義勇，輔佐明廷，不但匡主靜亂，且更足揚名竹帛呢。”
殷孝祖聽了，奮袂遽起，也不管甚麼妻孥，立刻率領文武二千人，隨僧韶來到建康。
是時，會稽各郡叛軍，愈逼愈近，內外憂危，群欲奔散，虧得殷孝祖馳至，所帶隨兵，饒有赳赳氣象，人心因是得安。宋主劉彧即進殷孝祖為撫軍將軍，督前鋒諸軍事，使往虎檻。
宋主劉彧再遣山陽王劉休佑為豫州刺史，督領輔國將軍劉勔，寧朔將軍呂安國等，北往討伐殷琰。又派巴陵王劉休若，率同建威將軍沈懷明，尚書張永，輔國將軍蕭道成等，東討孔顗。
孔顗方會合東南各軍，使出晉陵，氣焰甚盛。沈懷明至奔牛鎮，未敢進戰，但築壘自固。張永來到曲阿縣，更被嚇退，逃還延陵，前往到就劉休若之處。時方孟春，連日風雪，陂塘崩潰，眾無固志。諸將勸劉休若退保破岡，劉休若怒道：“叛賊未來，奈何輕退！敢有言退者斬！”諸將方不敢再言，乃築壘息甲，嚴陣以待。
適殿中御史吳喜，在宋主劉彧前自請效力，宋主劉彧於是授吳喜為建武將軍，特簡羽林勇士千人，遣往軍前。
吳喜曾經出使東吳之地，情性寬厚，得人敬愛，此次出兵，竟自成一路，往搗賊巢。吳人聞喜到來，多望風歡迎，不戰自服。足副大名。永世縣令孔景宣，本已叛應孔顗，為土民徐崇之所殺，向吳喜報告勝捷。
吳喜令徐崇之權署縣事，自己進兵至吳城，連破義興軍。義興太守劉延熙，築柵長橋，保郡自守。
吳喜正長驅進擊，又來了一個好幫手，乃是司徒參軍任農夫，也是自請從軍。到了義興，與吳喜一同攻打劉延熙，延熙保守不住，棚毀兵潰，投水自盡，眼見得義興克復了。
孔顗聞義興兵敗，不寒自栗。宋朝廷又遣派積射將軍江方興，御史王道隆，出發來到晉陵，督厲諸軍，連戰皆勝，攻克晉陵，各軍皆遁，王曇生、顧琛、袁標等，亦棄郡出走。吳郡、吳興、晉州各地，相繼蕩平。
捷書連達宋廷，宋主劉彧調張永等擊彭城，江方興等擊尋陽，但留建武將軍吳喜，與建威將軍沈懷明，東擊會稽。
吳喜遂引兵入柳浦，拔西陵，兵威所至，無不披靡。上虞縣令王晏，復起兵攻郡城，孔顗逃往嵴山，單剩一個尋陽王劉子房。劉子房系劉子勳弟，與劉子勳同年，乳臭猶存，怎能自保？當被王晏攻入，把他縛住，械送建康。復懸賞購顗，孔顗即而被獲，並孔顗從弟孔璪，一併誅死。
會稽平定，王曇生、顧琛、袁標等，無路可逃，不得已來到吳喜軍營，叩首乞憐。吳喜代達朝廷，均蒙赦宥；就是劉子房解到建康，也因他年幼無知，特別寬免，但貶為松滋侯。東路了。
山陽王劉休佑到了歷陽，令劉勔為先行，進軍小峴。
殷琰所署南汝陰太守裴季之，舉合肥城出降。寧朔將軍劉懷珍，又奉了宋主劉彧的遣發，帶同龍驤將軍王敬則等，共步騎五千人，詣劉勔營，助討壽陽，擊斬廬江太守劉道蔚。
。糧索琰殷向急，盡將食糧等順劉。餘月有約，持相北南勔劉與，唐宛拒東，千八兵率，等生天龐、烈道甫皇、倫柳、順劉將部遣琰殷
。全保難料，絕援孤勢，守自城嬰，兵散集招寶叔杜與但，急惶常非琰殷。壽薄進遂勔劉，散潰然自，食得從無軍順。還遁糧棄，劫所軍勔為次途，順餉糧運，乘百五千車發，寶叔杜軍參
。死走盡食，退敗兒索，下城戰大兒索與，將兩蕭、張。軍截阻，陵雎據奪，越靈傅守太原太偕，兒索薛子從都安薛。據所都安薛為，所治州徐系城彭，城彭攻打往前道蕭與永張
。誅伏即因，遜不言抗越靈，死貸頗，勇驍他主宋，康建送勔。勔送執，之廣王軍將衛武，西淮往奔越靈傅
：道嘆詩有。亡而地倒，矢流中，場一戰大，將軍尋與然果，終不他料已將他。風威示顯，導前儀羽用且，往直然昂，卒士顧不，力猛己自著仗，圻赭攻進，之攸沈守太尋同會，檻虎了到來馳祖孝殷惟
。扶手隻期頗局危，驅前效殳執王為
。軀捐竟戰一圻赭，足不謀餘有勇忠
。表續回下至容，何如負勝來後，沮大緒人眾，亡陣箭中祖孝殷
